赵健

作者: 责任编辑: 审核人: 访问量:3694发布时间:2023-08-28

姓名:赵健性别:职务:系副主任
职称:副研究员导师类别:硕士生导师办公室:D09 2-406
研究领域:

一、 生物信息学与多组学整合

1.复杂疾病的多组学整合分析: 整合基因组、转录组等组学数据,挖掘疾病发生发展的关键分子机制与生物标志物; 

2.基因组非编码区的计算生物学: 聚焦基因组非编码区,融合AI算法计算识别功能性调控元件,并解析其在复杂疾病中的调控机制。 

二、 生物医学大数据与算法工程

1.基于AI的生物医学大数据挖掘: 利用人工智能技术,挖掘隐藏在复杂生物网络中的调控规律与临床关联;

2.智能化数据分析工具与平台开发: 构建集成AI模型的生物信息分析工具与数据库。


电话:
Email:zhaojian@nuaa.edu.cn


【个人简介】

赵健,博士,南京航空航天大学自动化学副研究员,江苏省“333工程”第三层次培养对象、江苏省卓越博士后。长期从事非编码RNA生物信息学研究,主持国自然重点项目子课题、青年科学基金项目等多个国家与省部级项目,开发十余个计算工具及数据库,包括IRESbase、circASbase、IRESfinder、csORF-finder等。担任中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员、中国人工智能学会生物信息与人工生命专委会委员、中国计算机学会生物信息学专委会委员、江苏省生物信息学学会教育与科普工作委员会委员等,在BIB、GPB等SCI学术期刊发表论文30余篇,出版专著1部。


【教育经历】

2007.09-2011.06  南京航空航天大学 / 生物医学工程 / 学士

2011.09-2013.03  南京航空航天大学 / 生物医学工程 / 硕士

2013.04-2019.03  南京航空航天大学 / 生物医学工程 / 博士


【学术成果】

IRESfinder: IRES元件识别工具,https://github.com/xiaofengsong/IRESfinder;

IRESbase: IRES元件数据库,http://reprod.njmu.edu.cn/iresbase/;

DeepIRES: IRES元件识别工具,https://github.com/SongLab-at-NUAA/DeepIRES;

csORF-finder: 编码短肽ORF识别工具,https://github.com/xiaofengsong/csORF-finder;

lncScore: lncRNA识别工具,https://github.com/WGLab/lncScore;

GFusion: 融合基因识别工具,https://github.com/xiaofengsong/GFusion;

LncMiM: 竞争性三元组识别工具,https://github.com/xiaofengsong/LncMiM;

HisPhosSite: 组氨酸磷酸化修饰数据库,http://reprod.njmu.edu.cn/HisPhosSite/;

pHisPred: 组氨酸磷酸化修饰位点识别工具,https://github.com/xiaofengsong/pHisPred;

CircAI:  环状RNA中A-to-I编辑事件数据库,http://reprod.njmu.edu.cn/cgi-bin/circai/;

circASbase: 环状RNA可变剪接数据库,http://reprod.njmu.edu.cn/cgi-bin/circASbase/;

Deep-m7G: N7-甲基鸟苷位点识别工具,https://zenodo.org/records/15154497。


【承担项目】

1.国家自然科学基金重点项目   子课题负责人;

2.国家自然科学基金青年项目   主持;

3.中国博士后科学基金面上项目  主持;

4.中央高校基本科研业务费项目  主持;

5.江苏省重点研发计划项目    子课题负责人;

6.国家自然科学基金面上项目   主要参与人。






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